Приоритетными направлениями развития университета являются морские технологии, энергетика, приборостроение, информационные технологии, а также такие перспективные технологии, как нанотехнологии, микроэлектроника и другие.
Программа развития Севастопольского государственного университета будет реализована в два этапа. С 2016 по 2020 год будет модернизована материально-техническая база университета, будут внедрены новые образовательные программы и технологии, что приведет к формированию образовательной, научно-исследовательской и инновационной среды университета.
В справке к документу отмечается, что эффективность данной программы будет оцениваться на основе 12 мониторинговых и 10 дополнительных показателей, включая средний балл ЕГЭ поступивших студентов и удельный вес численности обучающихся.
Также подчеркивается, что по результатам реализации этой программы будет сформирована инновационная, гибкая и оперативно реагирующая на требования рынков труда и технологий образовательная, исследовательская и технологическая инфраструктура.
Решение о создании Севастопольского госуниверситета на базе семи существующих образовательных организаций было принято по распоряжению российского кабмина в октябре 2014 года. Тогда же премьер-министр Дмитрий Медведев поручил Минобрнауки России совместно с властями Севастополя и Росимуществом не позднее 1 января 2016 года завершить мероприятия, связанные с созданием и развитием университета.