Программа состоит из шести подпрограмм. Подпрограмма "Планирование развития транспортной системы" предполагает разработку комплексной схемы организации дорожного движения, программы комплексного развития транспортной инфраструктуры, обследование и оптимизацию маршрутной сети общественного транспорта.
В рамках подпрограммы "Формирование единого парковочного парка" в 2020 году в Севастополе должны появиться 10 перехватывающих правок, три из которых в 2017 году.
Основное мероприятие подпрограммы "Организация грузовых перевозок" – создание в Севастополе системы весогабаритного контроля транспортных средств.
Вопросы создания велосипедных дорожек и инфраструктуры в Севастополе должна решить подпрограмма "Создание инфраструктуры велосипедного транспорта".